XVIII A. II p. Sudeikiuose būta koplyčios, kuri sudegė 1800. 1806 pastatyta laikina bažnyčia, joje 1822 būta apgedusių 9 registrų vargonų. 1825 pastatyta dabartinė akmenų mūro bažnyčia, 1933 atnaujinta. Gali būti, kad maždaug tuo metu ir buvo pastatyti dabartiniai vargonai. Panašu, kad juos galėjęs padirbti Martynas Masalskis. Vargonų traktūra mechaninė, oro skirstymo dėžės išilginės, prospektas - vamzdžiai dekoratyviniai.
Rimantas Gučas „Lietuvos vargonai"
Sudeikių Švč. Mergelės Marijos bažnyčioje nuo 1936 m. vargoninkavo Pranciškus Jurgelėnas, Antanas Gražys (1926 05 03). 1946-1947 m. vargoninkavo Benjaminas Niaura (1927), XX a. IX dešimtmetyje - Jonas Jukna (1919). Šiuo metu Sudeikių bažnyčioje vargoninkauja Zita Lukošiūnienė.
Sudeikių Švč. Mergelės Marijos bažnyčios vargonininkė Zita Lukošiūnienė, vargonininko Jono Jurgelėno dukra
Vargonininkas Pranciškus Jurgelėnas 1933 m. Sudeikiuose.
Nuotrauka iš Utenos kraštotyros muziejaus rinkinių.